Bubble coalescence in interacting system of DNA molecules

نویسندگان

چکیده

We consider two models of interacting DNA molecules: First is (four parametric) bubble coalescence model in DNAs (shortly: BCI-DNA). Second (three a condensed molecules (shortly BCC-DNA). To study thermodynamics BCI-DNA and BCC-DNA we use methods statistical physics. Namely, define Hamiltonian each give their translation-invariant Gibbs measures (TIGMs). For the first model, find parameters such that corresponding has up to three TIGMs phases system) biologically meaning existence states: “No coalescence”, “Dominated soft zone”, “Bubble coalescence”. second show for any (admissible) parameters, this unique TIGM. This state where coalescence” phase dominates.

برای دانلود باید عضویت طلایی داشته باشید

برای دانلود متن کامل این مقاله و بیش از 32 میلیون مقاله دیگر ابتدا ثبت نام کنید

اگر عضو سایت هستید لطفا وارد حساب کاربری خود شوید

منابع مشابه

Mechanisms of bubble coalescence in silicic magmas

HAL is a multi-disciplinary open access archive for the deposit and dissemination of scientific research documents, whether they are published or not. The documents may come from teaching and research institutions in France or abroad, or from public or private research centers. L’archive ouverte pluridisciplinaire HAL, est destinée au dépôt et à la diffusion de documents scientifiques de niveau...

متن کامل

Bubble coalescence in breathing DNA: Two vicious walkers in opposite potentials

– We investigate the coalescence of two DNA-bubbles initially located at weak segments and separated by a more stable barrier region in a designed construct of double-stranded DNA. The characteristic time for bubble coalescence and the corresponding distribution are derived, as well as the distribution of coalescence positions along the barrier. Below the melting temperature, we find a Kramers-...

متن کامل

synthesis of platinum nanostructures in two phase system

چکیده پلاتین، فلزی نجیب، پایدار و گران قیمت با خاصیت کاتالیزوری زیاد است که کاربرد های صنعتی فراوانی دارد. کمپلکس های پلاتین(ii) به عنوان دارو های ضد سرطان شناخته شدند و در شیمی درمانی بیماران سرطانی کاربرد دارند. خاصیت کاتالیزوری و عملکرد گزینشی پلاتین مستقیماً به اندازه و- شکل ماده ی پلاتینی بستگی دارد. بعضی از نانو ذرات فلزی در سطح مشترک مایع- مایع سنتز شده اند، اما نانو ساختار های پلاتین ب...

Mechanisms and dynamics of bubble coalescence in silicic magmas

Mechanisms and dynamics of bubble coalescence in silicic magmas 1 Jonathan M. Castro (University of Mainz) 2 Alain Burgisser (ISTO-CNRS) 3 Ian Schipper (ISTO-CNRS) 4 Simona Mancini (ISTO-Université d’Orléans) 5 6 Abstract 7 Bubble coalescence is an important process that strongly affects magmatic degassing. 8 Without coalescence, bubbles remain isolated from one another in the melt, severely 9 ...

متن کامل

Bubble dynamics in DNA

The formation of local denaturation zones (bubbles) in double-stranded DNA is an important example for conformational changes of biological macromolecules. We study the dynamics of bubble formation in terms of a Fokker-Planck equation for the probability density to find a bubble of size n base pairs at time t, on the basis of the free energy in the Poland-Scheraga model. Characteristic bubble c...

متن کامل

ذخیره در منابع من


  با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید

ژورنال

عنوان ژورنال: International Journal of Biomathematics

سال: 2023

ISSN: ['1793-7159', '1793-5245']

DOI: https://doi.org/10.1142/s1793524523500389